1. Προκεχωρημένη Βιοχημεία

• Βιολογικές Mεμβράνες-οργάνωση-μεταγωγή σήματος. Σηματοδοτικά μονοπάτια υποδοχέων που συζεύγνυνται με G πρωτεΐνες, ετεροτριμερείς G πρωτεΐνες.

1. Δρόμος κυκλικής ΑΜΡ, πρωτεϊνική κινάση Α.
2. Υποδοχείς κυκλικής ΑΜΡ (Epac), ενεργοποίηση πρωτεϊνικής κινάσης Β  (Akt).
3. Δρόμος φωσφοϊνοσιτιδίου, πρωτεϊνική κινάση C.
4. Σηματοδότηση από Ca²⁺.
5. Κινάσες τυροσίνης, μικρές G πρωτεΐνες, ΡΙ-3 κινάση, ενεργοποίηση πρωτεϊνικής κινάσης Β (Akt).
6. ΜΑΡ κινάσες ( ERK1,2, JNKs, p38).
7. Σηματοδοτικά μονοπάτια ΝΟ, κυκλική GMP, πρωτεϊνική κινάση G.
8. Πλευρική διαμερισματοποίηση και λειτουργία της κυτταροπλασματικής μεμβράνης: εισοσώματα και διαμεμβρανικοί μεταφορείς
9. Μεταγραφικοί παράγοντες (CREB, CREM, NF-kB, AP-1, STAT), μέθοδοι διαπίστωσης της ενεργοποίησης των μεταγραφικών παραγόντων.
10. Προσταγλανδίνες.
11. Στεροειδείς ορμόνες.
12. Σηματοδοτικά μονοπάτια κύριων κυτταροκινών και αναπτυξιακών παραγόντων, IL-1, TNF-α, TGF-β (SMAD πρωτεΐνες), PDGF, EGF, FGF.

• Αλληλεπίδραση εξωκυττάριου χώρου και κυττάρου
• Ολοκλήρωση του μεταβολισμού σε προκαρυωτικά και ευκαρυωτικά κύτταρα. Μηχανισμοί ελέγχου του μεταβολισμού υδατανθράκων, πρωτεϊνών και λιπών.
• Δομή Πρωτεϊνών - Πειραματικές & Θεωρητικές Προσεγγίσεις.

2. Κλινική Βιοχημεία – Βιοχημική Ανάλυση

• Yγρή χρωματογραφία πήγματος, ιοντοανταλλαγής, συγγένειας. Aρχές, εφαρμογές.
• Υγρή χρωματογραφία υψηλής επίδοσης (HPLC): Είδη, αρχές, εφαρμογές και επιλογή τεχνικής. Αέρια χρωματογραφία (GC): Εφαρμογές στην ανάλυση. Χρωματογραφία υπερκριτικού ρευστού (SFC): Αρχές εφαρμογές
• Ηλεκτροφόρηση : Είδη, αρχές. Tριχοειδής ηλεκτροφόρηση (capillary electrophoresis-HPCE) και εφαρμογές της στην ανάλυση.
• Ενζυμικές μέθοδοι ανάλυσης (Χρήση ενζύμων στην ανάλυση). Χημεία και χρήση ενζύμων, εξειδίκευση, συνθήκες, εφαρμογές. Βιοαισθητήρες.
• Xρήση ραδιοϊσοτόπων στην ανάλυση.
• Ανοσοενζυμικές μέθοδοι ανάλυσης: Είδη, αρχές, εφαρμογές.
• Αυτοματισμός στην ανάλυση, Σύγχρονοι αυτόματοι αναλυτές,
• Κριτήρια επιλογής μεθόδου-Σχεδιασμός και ανάπτυξη μεθόδων ανάλυσης.
• Επιλογή μεθόδων για την ανάλυση βιολογικών υγρών.
• Βιοχημεία των κυριοτέρων οργάνων και ενδοκρινών αδένων
• Έλεγχος λειτουργίας οργάνων και ενδοκρινών αδένων.
• Αξιολόγηση αποτελεσμάτων.
• Ανάλυση μεταβολιτών, φαρμάκων και τοξικών ουσιών.
• Χημική οικολογία: Εφαρμογές βιοενεργών δευτερογενών μεταβολιτών φυσικής προέλευσης.
• Μέθοδοι ανάλυσης και μελέτης πρωτεϊνών, λιπιδίων και υδατανθράκων.

3. Βιβλιογραφική Επισκόπηση και Ερευνητική Μεθοδολογία

• Αναζήτηση, καταγραφή και παρουσίαση, της σχετικής με τη μεταπτυχιακή διπλωματική εργασία βιβλιογραφίας.
• Σειρά διαλέξεων σε σύγχρονα θέματα της εξειδίκευσης και σε θέματα που άπτονται της ανάπτυξης επικοινωνιακών δεξιοτήτων και δεξιοτήτων πληροφορικής.
• Βιβλιογραφική επισκόπηση του ερευνητικού πεδίου του θέματος της Μεταπτυχιακής Διπλωματικής Εργασίας (ΜΔΕ) και δημόσια παρουσίασή της.