Σας ενημερώνουμε ότι από 01.09.2025 έως 31.10.2025 θα είναι ανοιχτή η πλατφόρμα του ψηφιακού άλματος για την ηλεκτρονική ανανέωση εγγραφής στο Χειμερινό Εξάμηνο του Ακαδημαϊκού Έτους 2025-2026. Ως εκ τούτου, όσοι  μεταπτυχιακοί φοιτητές και υποψήφιοι Διδάκτορες είναι εγγεγραμμένοι στο ψηφιακό άλμα πρέπει να ανανεώσουν την εγγραφή τους μέσω της ηλεκτρονικής γραμματείας.

Οι μεταπτυχιακοί φοιτητές του ΔΠΜΣ «Εφαρμοσμένη Βιοχημεία: Κλινική Χημεία, Βιοτεχνολογία, Αξιολόγηση φαρμακευτικών Προϊόντων» μπορούν είτε να αποστείλουν στο e-mail της Γραμματείας (), είτε να παραδώσουν με φυσική παρουσία την επισυναπτόμενη αίτηση, συνοδευόμενη από το αποδεικτικό κατάθεσης της δόσης τελών φοίτησης.

Σας επισημαίνουμε ότι η ανανέωση εγγραφής είναι ΥΠΟΧΡΕΩΤΙΚΗ για όλους.

Περισσότερες πληροφορίες στο επισυναπτόμενο έγγραφο.

Aκαδ. ημερολόγιο για το έτος 2025-2026

Δι-Ιδρυματικό Πρόγραμμα Μεταπτυχιακών Σπουδών «Εφαρμοσμένη Βιοχημεία: Κλινική Χημεία, Βιοτεχνολογία και Αξιολόγηση Φαρμακευτικών Προϊόντων»

Παρουσίαση Μ.Δ.Ε.

Όνομα: Αγγελική Νάτσιου

Θέμα: «Διερεύνηση της οργάνωσης των ινών κολλαγόνου και της αρχιτεκτονικής του εξωκυττάριου χώρου στις αθηρωματικές πλάκες»

Επιβλέπουσα: Δρ. Χρυσοστόμη Γιαλελή, Ερευνήτρια, Πανεπιστήμιο Lund, Σουηδία

Ημερομηνία: 21/07/2025

Ώρα: 11:00

Zoom link:

https://upatras-gr.zoom.us/j/98403186871?pwd=2V44oOA1JG15IU8PIRaHVUpq1J3YTr.1

Περίληψη

Η αθηροσκλήρωση αποτελεί τον πρωταρχικό παράγοντα ανάπτυξης καρδιαγγειακής νόσου, την κύρια αιτία θνησιμότητας παγκοσμίως. Η παθογένεσή της ξεκινά με ενδοθηλιακή δυσλειτουργία και εξελίσσεται μέσω συσσώρευσης λιπιδίων, λέπτυνσης του ινώδους καλύμματος, ασβεστοποίησης και ανεξέλεγκτης φλεγμονής, οδηγώντας τελικά σε στένωση και ρήξη των αγγείων. Η δομή, η σύσταση και η αναδιαμόρφωση του αγγειακού εξωκυττάριου χώρου (ECM) είναι καθοριστικής σημασίας για την ανάπτυξη και εξέλιξη των αθηρωματικών πλακών. Από τα επιμέρους συστατικά του ECM, το κολλαγόνο αποτελεί θεμελιώδες στοιχείο για τη μηχανική σταθερότητα της πλάκας, καθώς συγκροτεί το ινώδες κάλυμμα. Καθώς η νόσος εξελίσσεται, η αποικοδόμηση του κολλαγόνου οδηγεί σε λέπτυνση του ινώδους καλύμματος, αυξάνοντας την ευπάθεια σε ρήξη. Πέρα από την ποσότητα του κολλαγόνου, παράγοντες όπως ο τύπος, ο προσανατολισμός, η δομική οργάνωση και ο βαθμός διασταύρωσης του κολλαγόνου είναι εξίσου σημαντικοί για τη σταθερότητα της πλάκας.

Η παρούσα μελέτη εξετάζει την οργάνωση του ECM σε ανθρώπινες αθηρωματικές πλάκες καρωτίδας, εστιάζοντας στη χωρική κατανομή και τα δομικά χαρακτηριστικά του κολλαγόνου.

Η οπτικοποίηση του κολλαγόνου πραγματοποιήθηκε μέσω ιστοχημικής χρώσης, ενώ η ποσοτική ανάλυση της αρχιτεκτονικής του ECM έγινε με τη χρήση της μακροεντολής TWOMBLI στο λογισμικό FIJI, η οποία επιτρέπει την εξαγωγή παραμέτρων, όπως ο προσανατολισμός των ινών, το μήκος και πάχος, οι διακλαδώσεις, η καμπυλότητα των ινών κολλαγόνου, καθώς και την πυκνότητα του ECM. Η ανάλυση TWOMBLI αποκάλυψε ότι οι περιοχές που είναι επιρρεπείς σε ρήξη παρουσιάζουν ένα διακριτό μοτίβο οργάνωσης του ECM, το οποίο χαρακτηρίζεται από μειωμένη πυκνότητα και πάχος ινών κολλαγόνου, απουσία οργανωμένου προσανατολισμού και πιο χαλαρή αρχιτεκτονική.

Η ισχυρή συσχέτιση μεταξύ των μετρικών που προκύπτουν από το TWOMBLI και της οπτικής ιστολογικής αξιολόγησης αναδεικνύει τη χρησιμότητα αυτής της μεθόδου για την ποσοτικοποίηση της αρχιτεκτονικής του ECM. Τα ευρήματα αυτά αναδεικνύουν τον κρίσιμο ρόλο της οργάνωσης του ECM - και συγκεκριμένα της δομής του κολλαγόνου - στον καθορισμό της σταθερότητας της πλάκας. Τα διακριτά πρότυπα οργάνωσης του κολλαγόνου μπορούν να χρησιμεύσουν ως δείκτες αυξημένης ευπάθειας, προσφέροντας δυνητικούς βιοδείκτες για την αξιολόγηση του κινδύνου ρήξης.

 Angeliki Natsiou - MSc Thesis presentation

                                                   Παρουσίαση Μ.Δ.Ε.

Ονοματεπώνυμο: Τσιαντής Ευάγγελος

Θέμα: Μελέτη της επίδρασης των μορίων του εξωκυττάριου χώρου στον καρκίνο του μαστού

Επιβλέπων: Καθηγητής Νίκος Καραμάνος

Ημερομηνία: 16 Ιουλίου 2025

Ώρα: 5μμ

Τόπος:

https://upatras-gr.zoom.us/j/92459480059?pwd=UIHlY7s4Fr0qHJHzbXHh7DB9Kwhaqe.1

                                                         Περίληψη

Ο καρκίνος του μαστού αποτελεί μια από τις πιο συνηθισμένες μορφές καρκίνου στις γυναίκες. Καθοριστικό ρόλο στην ανάπτυξη, εξέλιξη και εξάπλωση του παίζουν τα οιστρογόνα και κυρίως η 17β-οιστραδιόλη, η οποία ασκεί τη δράση της μέσω των σηματοδοτικών μοναπατιών των οιστρογονικών υποδοχέων ERα και ERβ και την αναδιαμόρφωση του εξωκυττάριου διακυτταρικού δικτύου (ECM). Μεταξύ των κύριων συστατικών του ECM συμπεριλαμβάνονται τα πρωτεολυτικά ένζυμα μεταξύ των οποίων πρωτεύοντα ρόλο παίζουν οι μεταλλοπρωτεϊνάσες (MMPs), οι οποίες συμμετέχουν στην αναδιαμόρφωση του ECM, ενώ τα αυξημένα επίπεδα έκφρασης τους συνδέονται κατά κανόνα με αυξημένη επιθετικότητα και κακή πρόγνωση. Η αναδιαμόρφωση του ECM συνδέεται με την ενεργοποίηση σηματοδοτικών μονοπατιών τα οποία επηρεάζουν σε μεγάλο βαθμό και τo μεταστατικό δυναμικό των καρκινικών κυττάρων.

Στην παρούσα διπλωματική εργασία διερευνήθηκε αρχικά με τη βοήθεια προγραμμάτων βιοπληροφορικής η συσχέτιση της έκφρασης των MMP1, MMP2, MMP9, MMP7 και MMP14 με τα επίπεδα έκφρασης των ERs (Kaplan Meier Plotter, TNM Plotter). Σε επόμενο στάδιο μελετήθηκε η έκφραση αυτών των πέντε MMPs συγκριτικά σε διαφορετικά είδη καρκίνου μαστού με τη χρήση των βάσεων δεδομένων (UALCAN, GEPIA2). Επίσης διερευνήθηκε η προγνωστική τους αξία ως βιοδείκτες μέσω προγράμματος μετα-ανάλυσης (ROC Plotter). Τέλος μελετήθηκε η αλληλεπίδραση άμεση και έμμεση των MMPs και άλλων μορίων του ECM μέσω  της βάσης δεδομένων (STRING), καθώς και η πολυγονιδιακή ανάλυση για εκτίμηση βιοδεικτών μέσω μελέτης για τις γονιδιακές τους εκφράσεις.

Τα αποτελέσματα της εργασίας αυτής σηματοδοτούν τον επαναπροσδιορισμό της προγνωστικής αξίας των MMPs μέσω του συνδυαστικού ρόλου που παίζουν στην ανάπτυξη, εξάπλωση και μεταστατική ικανότητα των καρκινικών κυττάρων μαστού με την αναδιαμόρφωση του μικροπεριβάλλοντος του όγκου.

_______________________

Nikos Karamanos, PhD, ERT

Professor of Biochemistry

E-mail:

Board Member: ISMB [1]  I HSBMB [2]

Series editor: Biology of ECM [3]

Book editor: ECM Pathobiology & Signaling  [4]

Editor: FEBS J  [5]I Mol Bio Rep Section ECM Biology [6] Associate Editor: Cellular & Molecular Oncology  [7](Frontiers [8]) I Cancers [9]

Profiles:  Dept website  [10]I Google Scholar [11] I ResearchGate [12] I Orcid [13] I https://research.com/u/nikos-k-karamanos

Web of Science_Highly Cited researcher 2022 [14]

Dear all,

Please, find attached the September examination schedule of Academic Year 2024-2025 of the JMSc Programme «Applied Biochemistry: Clinical Chemistry, Biotechnology, Evaluation of Pharmaceutical Products».

Best wishes,

D. Vynios

September 2024-2025 Exams

Dear All,

Please, find attached the abstract of the seminar of Rami Babas, post-graduate student of the JMSC Programme in Applied Biochemistry: "Biotechnology, Clinical Chemistry, evaluation of pharmaceutical products", which will take place on Friday, June 27, 2025, at 14.00.

Sincerely,

D. H. Vynios

 R. Babas - Abstract

Dear all,

Please, find attached the abstracts of the seminars of the Post-graduate students of JMSc Programme in Applied Biochemistry: "Biotechnology, Clinical Chemistry, Evaluation of Pharmaceutical products", D.I. Zafeirakopoulos (27/06/25, 13.00), P. Megremi (27/06/25, 13.30),  and L. Delivoria (01/07/25, 10.00).

Sincerely,

D. H. Vynios

Dimitrios-Ilias Zafeirakopoulos - Abstract

P. Megremi - Abstract

Lygeri Delivoria - Abstract

Πληροφορίες στα επισυναπτόμενα.

Προκήρυξη του ΔΠΜΣ «Εφαρμοσμένη Βιοχημεία: Κλινική Χημεία, Βιοτεχνολογία, Αξιολόγηση Φαρμακευτικών Προϊόντων» 2025-2026

Announcement of the Join Post Graduated Programme in Applied Biochemistry - 2025-2026

ΑΙΤΗΣΗ ΥΠΟΨΗΦΙΟΤΗΤΑΣ

Ονοματεπώνυμο: Ραπασάρδου Διονυσία

Θέμα: Επίδραση σιμβαστατίνης παρουσία ορμονών στην έκφραση πρωτεογλυκανών σε κύτταρα τριπλά αρνητικού καρκίνου του μαστού.

Επιβλέπων: Δημήτριος Βύνιος, Καθηγητής

Ημερομηνία: Τετάρτη 11 Ιουνίου 2025

Ώρα: 10:00

Τόπος: https://upatras-gr.zoom.us/j/98403186871?pwd=2V44oOA1JG15IU8PIRaHVUpq1J3YTr.1

ΠΕΡΙΛΗΨΗ

Ο καρκίνος του μαστού είναι ο πιο συχνός τύπος καρκίνου στις γυναίκες παγκοσμίως, με τον τριπλά αρνητικό καρκίνο (TNBC) να αποτελεί έναν ιδιαίτερα επιθετικό υπότυπο, καθώς δεν εκφράζει υποδοχείς οιστρογόνων, προγεστερόνης ή HER2. Λόγω της απουσίας στοχευμένων θεραπειών και της κακής πρόγνωσης, η έρευνα έχει στραφεί τα τελευταία χρόνια στην αναζήτηση νέων θεραπευτικών προσεγγίσεων.

Σκοπός της εργασίας ήταν η διερεύνηση της επίδρασης της σιμβαστατίνης — μιας στατίνης με γνωστή αντικαρκινική δράση — στην έκφραση πρωτεογλυκανών και των ενζυμών που σχετίζονται με τη βιοσύνθεση γλυκοζαμινογλυκανών, σε κυτταρικά μοντέλα TNBC (MDA-MB-231 και Hs578T). Παράλληλα, εξετάστηκε και η δράση των στεροειδών ορμονών 17β-οιστραδιόλης και προγεστερόνης, είτε μόνες είτε σε συνδυασμό με τη σιμβαστατίνη.

Τα αποτελέσματα έδειξαν διαφοροποιημένη ρύθμιση των ενζύμων CHPF, CHPF2, CHSY1 και CHSY3, ανάλογα με τη συγκέντρωση της σιμβαστατίνης, την παρουσία ορμονών και τον κυτταρικό τύπο. Ιδιαίτερο ενδιαφέρον παρουσίασε η πρωτεογλυκάνη decorin, η οποία εμφάνισε μείωση σε επίπεδο mRNA αλλά αύξηση σε επίπεδο πρωτεΐνης, γεγονός που πιθανόν σχετίζεται με μετα-μεταφραστικές τροποποιήσεις ή μειωμένη αποικοδόμηση. Η έκφραση της versican παρουσίασε μεταβολές που δεν ήταν απόλυτα ξεκάθαρες, αλλά φαίνεται να επηρεάζεται από την παρουσία ορμονών και τη δόση της σιμβαστατίνης.

Επιπλέον, μελετήθηκε η επίδραση της σιμβαστατίνης στην ανάπτυξη σφαιροειδών από τα κύτταρα. Παρατηρήθηκαν αλλαγές στη μορφή και την κυκλικότητα των σφαιροειδών, που υποδεικνύουν μείωση της κυτταρικής συνοχής και πιθανή διαφοροποίηση του φαινοτύπου.

Συνολικά, τα ευρήματα δείχνουν ότι η σιμβαστατίνη επηρεάζει τη σύνθεση και τη σταθερότητα του εξωκυττάριου μικροπεριβάλλοντος στον TNBC, ενισχύοντας την πιθανή της χρησιμότητα ως συμπληρωματική θεραπευτική επιλογή.

ABSTRACT

Breast cancer is the most common cancer type in women worldwide, with triple-negative breast cancer (TNBC) representing one of its most aggressive subtypes, lacking expression of estrogen, progesterone, and HER2 receptors. Due to the absence of targeted therapies and its poor prognosis, research has increasingly focused on identifying novel therapeutic strategies.

This study aimed to investigate the effects of simvastatin — a statin with known anticancer activity — on the expression of proteoglycans and enzymes involved in glycosaminoglycan biosynthesis, using TNBC cell lines (MDA-MB-231 and Hs578T). In parallel, the potential modulatory role of the steroid hormones 17β-estradiol and progesterone was assessed, either alone or in combination with simvastatin.

Our findings revealed differential regulation of CHPF, CHPF2, CHSY1, and CHSY3 depending on simvastatin concentration, hormonal context, and cell type. The proteoglycan decorin showed reduced mRNA expression but increased protein levels, possibly due to post-translational modifications or decreased degradation. Versican expression also varied, although no consistent pattern was observed, and appeared to be hormone- and dose-dependent. In addition, the effect of simvastatin on spheroid formation was studied. Morphological changes in spheroid structure and circularity were detected, suggesting reduced cell cohesion and potential phenotypic alteration.

Overall, our results indicate that simvastatin affects extracellular matrix dynamics in TNBC models, supporting its potential role as an adjuvant therapeutic agent.

Ονοματεπώνυμο: Χρυσαυγή Γουρδούπη

Θέμα: Αξιολόγηση της σηματοδότησης των υποδοχέων EGFR και IGF-IR στην έκφραση μακρομορίων του εξωκυττάριου χώρου και στις λειτουργικές ιδιότητες σε δισδιάστατες καρκινικές καλλιέργειες

και σε 3D σφαιροειδή.

Επιβλέπων: Καθηγητής Νίκος Καραμάνος

Ημερομηνία: 04/06/2025

Ώρα: 10 πμ

Τόπος: https://upatras-gr.zoom.us/j/99967801031?pwd=VuhPwGQLaoQ54ZX6IHyai2BYuIsWIS.1

Ο καρκίνος είναι μία από τις σοβαρότερες ασθένειες που πλήττουν τον άνθρωπο στις ανεπτυγμένες χώρες. Σύμφωνα με στατιστικές μελέτες, αποτελεί τη δεύτερη πιο συχνή αιτία θανάτου μετά τα καρδιαγγειακά νοσήματα. Ο καρκίνος του μαστού, ειδικότερα, αποτελεί μία νόσο με σημαντική φαινοτυπική και γονοτυπική ετερογένεια, η οποία αντανακλάται στην αναδιαμόρφωση του εξωκυττάριου χώρου (ECM). Ο ECM είναι ένα εξαιρετικά δυναμικό μακρομοριακό δίκτυο, το οποίο υφίσταται συνεχείς μεταβολές τόσο σε φυσιολογικές όσο και σε παθολογικές καταστάσεις. Η δράση διαφόρων μορίων-ρυθμιστών του ECM μπορεί να μεταβάλει τη σύσταση του, μια διαδικασία που συνδέεται στενά με την εξέλιξη του καρκίνου. Οι υποδοχείς κινάσης τυροσίνης (RTKs) αποτελούν σημαντικούς ρυθμιστές της κυτταρικής σηματοδότησης που επηρεάζουν την έκφραση γονιδίων και τις λειτουργικές ιδιότητες των κυττάρων. Ανάμεσα σε αυτούς, οι υποδοχείς του επιδερμικού αυξητικού παράγοντα (EGFR) και του αυξητικού παράγοντα ομοιάζοντος της ινσουλίνης (IGF-IR) θεωρούνται βασικοί παράγοντες για τη διάγνωση και τη θεραπεία του καρκίνου του μαστού, καθώς σχετίζονται με την ανάπτυξη του όγκου και την ικανότητα διήθησης. Επιπλέον, οι συγκεκριμένοι υποδοχείς επηρεάζουν τη σύσταση του ECM τόσο σε υγιείς όσο και σε παθολογικές καταστάσεις. Η αξιολόγηση των μεταβολών που υφίσταται ο ECM μετά από αναστολή των μονοπατιών σηματοδότησης EGFR και IGF-IR αποτελεί ένα αναδυόμενο πεδίο στην έρευνα για τον καρκίνο και τη φαρμακολογική στόχευση.

Αξιοσημείωτο είναι ότι η αλληλεπίδραση μεταξύ των EGFR και IGF-IR διαδραματίζει σημαντικό ρόλο στη ρύθμιση της συμπεριφοράς και της μορφολογίας των καρκινικών κυττάρων, όπως τα MDA-MB-231 (υψηλής επιθετικότητας) και τα MCF-7 (ορμονοεξαρτώμενα, χαμηλής διηθητικής ικανότητας). Αξίζει να σημειωθεί ότι οι έως τώρα μελέτες βασίζονται κυρίως σε συμβατικά μοντέλα δισδιάστατων κυτταροκαλλιεργειών (2D), όπου τα κύτταρα αναπτύσσονται πάνω σε πλάκες πολυστυρενίου και χρησιμοποιούνται για δεκαετίες στη μελέτη των επιδράσεων μεταξύ μορίων σηματοδότησης και υποδοχέων. Ωστόσο, τα 2D μοντέλα αδυνατούν να αναπαραγάγουν τη δυναμική του μικροπεριβάλλοντος του όγκου συγκριτικά με την ανάπτυξη, αύξηση και μετάσταση του στον τρισδιάστατο κόσμο. Για τον σκοπό αυτό, τα νεότερα μοντέλα τρισδιάστατων κυτταροκαλλιεργειών θεωρούνται περισσότερο αντιπροσωπευτικά των βιοχημικών χαρακτηριστικών και των κυτταρικών αλληλεπιδράσεων των όγκων σε σύγκριση με τις συμβατικές 2D πλατφόρμες. Για τον λόγο αυτό, η παρούσα μελέτη αξιοποιεί 3D κυτταρικά μοντέλα προκειμένου να αξιολογήσει, μέσω πειραμάτων σε γονιδιακό επίπεδο αλλά και λειτουργικών την επίδραση αναστολέων των μονοπατιών EGFR και IGF-IR (μεμονωμένα ή σε συνδυασμό) στην έκφραση βασικών συστατικών του εξωκυττάριου χώρου καθώς και στις λειτουργικές ιδιότητες των κυττάρων του καρκίνου του μαστού (πολλαπλασιασμός, μετανάστευση, εξάπλωση), συγκρίνοντας τα νέα 3D μοντέλα με τα παραδοσιακά 2D.

Τα αποτελέσματά μας ανέδειξαν την αλληλεπίδραση μεταξύ IGF-IR και EGFR, καθώς και την επίδραση καθενός ξεχωριστά στην ικανότητα πολλαπλασιασμού και μετανάστευσης των κυττάρων. Επιπλέον, φαινοτυπικές μεταβολές αναδείχθηκαν μεταξύ των 2D και 3D συνθηκών, οι οποίες σχετίζονταν με την έκφραση σημαντικών μορίων, όπως οι μεταλλοπρωτεϊνάσες (MMPs).

Η παρούσα έρευνα επιβεβαίωσε βασικά χαρακτηριστικά των δύο κυτταρικών σειρών τόσο υπό 2D όσο και υπό 3D συνθήκες, ενώ ανέδειξε και νέες ιδιότητες και αποκρίσεις που εξαρτώνται από το περιβάλλον της κυτταροκαλλιέργειας. Συνολικά λοιπόν, τα ευρήματά μας είναι ιδιαίτερα ενθαρρυντικά, τόσο για την εμβάθυνση στην κατανόηση της σηματοδότησης μέσω των υποδοχέων κινάσης τυροσίνης RTKs — με ιδιαίτερη έμφαση στην περίπλοκη αλληλεπίδραση μεταξύ των μονοπατιών EGFR και IGF-IR  όσο και για την ανάδειξη των 3D μοντέλων ως αποτελεσματικών εργαλείων στην αξιολόγηση των βιολογικών διεργασιών που διέπουν τα διαφορετικά φαινοτυπικά χαρακτηριστικά του καρκίνου του μαστού.